आमाशय में हाइड्रोक्लोरिक अम्ल भोजन के लिए अम्लीय माध्यम बनाता है। इस माध्यम में पेप्सिन एंजाइम प्रोटीन के पाचन में सहायता करता है।
यह अम्ल भोजन के साथ आए कई हानिकारक जीवाणुओं को नष्ट करने में भी मदद करता है।