मस्तिष्क शरीर का नियंत्रण केंद्र है। यह शरीर के विभिन्न अंगों के कार्यों का समन्वय करता है और प्राप्त सूचनाओं के अनुसार प्रतिक्रिया करवाता है।
यह सोचने, समझने, सीखने, स्मरण रखने और निर्णय लेने में सहायता करता है। यह ऐच्छिक क्रियाओं तथा देखने, सुनने और स्पर्श जैसी संवेदनाओं से भी संबंधित है।
यह शरीर का संतुलन बनाए रखता है और चलने या लिखने जैसी ऐच्छिक क्रियाओं में मांसपेशियों के समन्वय में सहायता करता है।
यह श्वसन और हृदय की धड़कन जैसी अनैच्छिक क्रियाओं को नियंत्रित करने में सहायता करता है।
मस्तिष्क कुछ त्वरित प्रतिक्रियाओं के नियंत्रण और समन्वय में भी भाग लेता है। शरीर को तुरंत प्रतिक्रिया देने वाली कई प्रतिवर्ती क्रियाओं का मुख्य नियंत्रण मेरुरज्जु में होता है।
इस प्रकार मस्तिष्क संवेदनाओं को समझता है, शरीर की क्रियाओं का नियंत्रण करता है और आवश्यक प्रतिक्रियाएँ उत्पन्न करवाता है।